Геном орангутана, полный неожиданностей

У орангутана, самой сидячей из человекообразных обезьян, есть необычно стабильная ДНК, также. Исследователи только что закончили последовательный из всего генома нашего родственника с оранжевыми волосами, и они нашли к их удивлению, что его ДНК изменялась намного менее существенно в течение долгого времени, чем имеет того из людей или шимпанзе. «Орангутан является решающим голосом», говорит Девин Локк, структурный генетик в Вашингтонском университете Медицинская школа в Сент-Луисе, Миссури, кто возглавил орангутана, упорядочивающего проект.Геном орангутана имел еще одно большое удивление.

Локк и коллеги упорядочили шесть суматранских и пять орангутанов Bornean, классифицирующихся как различные разновидности. Обезьяны физически отделялись в течение по крайней мере 21 000 лет — в прошлый раз, когда перешейки между этими двумя островами существовали — и более ранние исследования оценили, что они стали различимыми видами больше чем 1 миллион лет назад.

Но новый анализ, сообщил онлайн сегодня по своей природе, переписывает историю: кажется, что они разделили пути всего 400,000 лет назад. «Большинство предыдущих исследований использовало маленькие наборы маркеров и ограниченную сумму последовательности ДНК», говорит Локк. «Статистическая энергия настолько больше, когда у Вас есть целый геном в вашем распоряжении».Орангутан теперь присоединяется к шимпанзе и людям как третья человекообразная обезьяна для упорядочивания ее генома. «Геном орангутана является замечательным ресурсом», говорит эволюционный генетик Сванте Пабо из Макс. Планка Института Эволюционной Антропологии в Лейпциге, Германия. «Это поможет разъяснить, как каждая часть человеческих и африканских геномов обезьяны связана друг с другом и развита».Такое понимание уже входит.

Орангутаны породили приблизительно 12 миллионов к 16 миллионов лет назад, дав их геномам намного больше времени для развития, чем те из людей и шимпанзе, разделивших на их собственные происхождения 5 миллионов к 6 миллионов лет назад. Но сравнение этих трех геномов показывает, что люди и шимпанзе теряют или получают новые гены при дважды уровне орангутанов.

Причина может иметь отношение к протяжениям ДНК, названной ретротранспозонами. Эти ключевые факторы развития подскакивают вокруг генома, создавая новые гены, нанося вред существующим, или изменяя регуляцию генов. Новые данные показывают, что общие ретротранспозоны, известные как элементы Alu, переместили геном орангутана намного меньше, чем они имеют в геномах шимпанзе и человеке. «Я не хочу сказать, что [события ретротранспозиции Alu] отключены у орангутанов, но они были подавлены», говорит Локк.

Исследователи также обнаружили, что в течение долгого времени структура хромосом орангутана изменилась мало, который может быть связан с открытием элемента Alu. Другие исследователи предположили, что прочная структурная разновидность в людях и шимпанзе, возможно, поощрила увеличенную аналитику.

Но Локк отмечает, что орангутаны также очень умны. «Если у орангутанов было очень мало структурной разновидности, возможно это расцепляет структурную разновидность от аналитики», говорит он.Отдельное, но связанное исследование, изданное сегодня в Отчетах о научно-исследовательской работе Генома еще одно неожиданное открытие от сравнения трех геномов человекообразной обезьяны.

Бригада во главе с Миккелем Х. Ширупом и Томасом Мэйландом из Орхусского университета в Дании (оба соавтора отчета Природы) обнаружила, что некоторые регионы генома человека более близко напоминают орангутана, чем шимпанзе. Это отражает факт, что в это время люди, отделенные от общего предка с шимпанзе, обе разновидности имели ту же наследственную ДНК орангутана. Но люди и шимпанзе развивались отдельно в течение миллионов лет. В процессе, шимпанзе по таинственным причинам потеряли некоторую ДНК орангутана это, люди сохранили.

Больше неожиданностей, несомненно, прибудет, поскольку исследователи сравнивают геномы еще большего количества обезьян. Проекты упорядочить другие двух человекообразных обезьян, горилл и бонобо, идут полным ходом.