Новое исследование Калифорнийского университета в Ирвине показывает, что белок, ответственный за генетические изменения, приводящие к различным видам рака, также может быть ключом к более эффективной целевой терапии рака.
Исследование, опубликованное сегодня в Nature Communications, озаглавлено, "Количественная оценка текущей активности APOBEC3A в опухолевых клетках путем мониторинга редактирования РНК в горячих точках," показывает, как геномная нестабильность, вызванная белком APOBEC3A, обеспечивает ранее неизвестную уязвимость раковых клеток.
Каждый день в клетках человека происходят десятки тысяч случаев повреждения ДНК. В раковых клетках экспрессия белка APOBEC3A является одним из наиболее распространенных источников повреждений и мутаций ДНК. Хотя мутации, вызываемые этими конкретными белками в раковых клетках, способствуют эволюции опухоли, они также вызывают разрывы в ДНК, которые создают уязвимость.
"Нацеливание на раковые клетки с высоким уровнем активности белка APOBEC3A и одновременное нарушение реакции на повреждение ДНК, необходимой для восстановления повреждений, вызванных APOBEC3A, может быть ключом к более эффективным методам лечения рака," сказал Реми Бьюиссон, доктор философии.D., старший научный сотрудник и доцент кафедры биологической химии медицинского факультета UCI. "Однако, чтобы использовать уязвимость раковых клеток, важно сначала количественно измерить активность белка в опухолях."
Чтобы понять роль APOBEC3A в эволюции опухоли и воздействовать на уязвимости, вызванные APOBEC3A, исследователи разработали анализ для измерения активности APOBEC3A по редактированию РНК в раковых клетках. Поскольку APOBEC3A трудно определить в опухолях, разработка высокочувствительного метода измерения активности имела решающее значение. Используя мутации горячей точки РНК, идентифицированные в APOBEC3A-положительных опухолях, команда разработала анализ с использованием цифровой ПЦР с каплями и продемонстрировала его применимость к клиническим образцам от больных раком.
"Наше исследование представляет новую стратегию отслеживания нарушения регуляции APOBEC3A в опухолях, предоставляя возможности для изучения роли APOBEC3A в эволюции опухоли и нацеливания на уязвимость, вызванную APOBEC3A, в терапии," сказал Buisson. "Мы ожидаем, что анализ APOBEC3A на основе мутаций РНК значительно продвинет наше понимание функции белка в онкогенезе и позволит нам более эффективно использовать уязвимости, которые он создает в терапии рака."