Редкие генетические варианты – изменения в ДНК, которые несут только относительно немного людей в населении. Исследование UK10K было разработано, чтобы исследовать вклад этих редких генетических вариантов к человеческой болезни и ее факторам риска.«Проект сделал важные новые вклады в описание роли редких генетических вариантов в широком наборе сценариев болезни и человеческих черт». говорит доктор Николь Соранзо, соответствующий автор от Института Wellcome Trust Sanger. «Это показало, что ценность упорядочивания нескольких тысяч людей высока для очень проникающих, редких заболеваний, но что для сложных черт и болезней намного большие объемы выборки будут требоваться в будущих исследованиях. Данные и результаты, приведенные этим проектом, будут способствовать для этих будущих усилий».
Проект изучил почти 10 000 человек, и здоровых и затронутых болезнью. Условия включали очень редкие беспорядки, унаследованные в семьи и больше распространенных заболеваний, таких как аутизм, шизофрения и ожирение.
У здоровых людей были изучены 64 различных биомедицинских фактора риска, такие как кровяное давление или уровни холестерина. Характеризуя последовательность ДНК этих людей, проект получил сведения о вкладе редких разновидностей к широкому набору сценариев болезни и обнаружил новые генетические варианты и гены, подкрепляющие риск заболевания.«Проект UK10K увеличил разрешение генетических открытий. Это позволило доступ к намного более плотному набору вариантов в геноме в британском населении, которое может использоваться, чтобы усовершенствовать наше понимание генетического последствия на фенотипичных чертах», объясняет Ричард Дербин старший исследователь UK10K в Институте Sanger. «В более ранних исследованиях могли быть проанализированы или очень редкие разновидности с большими эффектами или общие варианты, которые обычно только имеют небольшие эффекты.
Теперь мы были в состоянии исследовать увеличенную часть спектра изменения, промежуточного очень редкое и общие».Серия работ, опубликованных по своей природе и Генетика Природы в сотрудничестве с другими следователями, демонстрирует ценность этих данных для генетических открытий.В то время как усилия продолжают характеризовать генетические подкрепления сложных болезней, данные и результаты этого исследования, как ожидают, позволят следующую волну открытий.
Справочная группа последовательности UK10K, описанная более подробно в сопутствующей работе, опубликованной по своей природе Коммуникации, как показывали, значительно увеличила способность характеризовать редкие разновидности в образцах значительной части населения, доступных международному научному сообществу. Этот ресурс позволит исследователям ‘заполнить’ недостающие данные из более низких исследований генотипа резолюции, позволяя им исследовать полные генотипы более быстро и дешево.Кроме того, авторы развивали сетевой браузер ассоциации на основе платформы Развлечения, описали в сопутствующей статье по Биоинформатике.
Этот браузер генома позволяет легкий поиск результатов ассоциации для всех черт риска заболевания, проанализированных в исследовании. Ученые, расследующие эти определенные факторы риска заболевания, будут в состоянии непосредственно получить доступ к последствию последовательности ДНК человека, чтобы видеть, насколько распространенный любые генетические варианты, которые они имеют, и с какими чертами эти изменения связаны.
«Проект UK10K был огромным обязательством и заложил основы для будущих исследований», говорит Клаудия Вальтер, ведущий автор от Института Sanger. «Например, выгода новой справочной группы UK10K haplotype уже понимается в исследованиях международных консорциумов, а также 0.5M люди британское исследование BioBank».