В совместном исследовании исследователи из Китайской академии медицинских наук и Пекинского медицинского колледжа, BGI, Медицинского колледжа Университета Шаньтоу и других учреждений выявили важные изменения связанных с опухолью генов и канцерогенных путей при плоскоклеточном раке пищевода (ESCC), одном из наиболее распространенных. ведущая причина смерти от рака во всем мире. Эта всесторонняя работа была опубликована в Интернете сегодня в международном журнале Nature, что дает новый откровенный взгляд на разработку новых биомаркеров для терапевтических стратегий этой наиболее распространенной формы рака пищевода.
ESCC – наиболее распространенный тип рака пищевода, на который приходится 90% гистопатологических форм. В настоящее время отсутствуют клинические подходы к ранней диагностике и лечению пациентов с ESCC, а общая пятилетняя выживаемость составляет около 10 процентов. Между тем, полный репертуар геномных событий, ведущих к патогенезу ESCC, остается неясным. Таким образом, существует острая необходимость в обнаружении биомаркеров на уровне всего генома, которые могут значительно улучшить терапевтические стратегии ESCC.
В этом исследовании исследователи провели комплексный геномный анализ у 158 китайских пациентов с ESCC, включая полногеномное секвенирование в 17 случаях ESCC и полное экзомное секвенирование в 71 случае, из которых 53 случая и еще 70 случаев ESCC были подвергнуты сравнительной геномной гибридизации. (a-CGH) анализ. Эта работа является частью исследовательских проектов Международного консорциума генома рака (ICGC).
Основываясь на данных секвенирования, они идентифицировали 8 значительно мутировавших генов, связанных с ESCC, включая шесть хорошо известных генов, связанных с ESCC (TP53, RB1, CDKN2A, PIK3CA, NOTCH1 и NFE2L2), один ген, связанный с опухолью (ADAM29), который никогда не описан в ESCC, и один новый ген (FAM135B), о котором ранее не сообщалось о раковых заболеваниях, но наблюдалось, что он может значительно усиливать рост клеток, образование колоний, миграцию и инвазию, а также другие фенотипы злокачественных клеток, что позволяет предположить, что FAM135B может вносить вклад в развитие ESCC.
11q13.3-13.Ранее сообщалось, что область 4 амплифицируется при многих раковых заболеваниях человека. В этом исследовании исследователи идентифицировали одну микроРНК (MIR548K), кодируемую в этой области, и обнаружили, что она была охарактеризована как новый онкоген и функциональные тесты, которые продемонстрировали, что MIR548K усиливает злокачественные фенотипы клеток ESCC. Авторы упоминают в документе, что это первый случай, когда MIR548K был продемонстрирован при раке человека. Кроме того, они также обнаружили, что некоторые важные гены-регуляторы гистонов, такие как MLL2, ASH1L, MLL3, SETD1B и CREBBP / EP300, часто изменяются в ESCC.
Впоследствии оценка пути показала, что соматические аберрации в основном участвуют в путях Wnt, клеточного цикла и Notch. Интересно, что геномный анализ показал, что ESCC и плоскоклеточный рак головы и шеи (HNSCC) имеют общие патогенетические механизмы, а развитие ESCC связано с употреблением алкоголя.Эти результаты позволят по-новому взглянуть на понимание туморогенеза ESCC и помогут клиницистам разработать более эффективные диагностические и терапевтические подходы к ESCC.
Доктор. Циминь Чжань, главный исследователь этого проекта и директор государственной ключевой лаборатории молекулярной онкологии онкологической больницы Китайской академии медицинских наук, сказал:, "Несомненно, результаты этого проекта предоставляют новое понимание механизма, лежащего в основе этого злокачественного ESCC, и позволяют нам изучить потенциальные диагностические биомаркеры и мишени для лекарств, а также разработать полезные клинические терапевтические подходы. Что еще более важно, завершение проекта имеет большое значение, поскольку рак пищевода является одним из видов рака с высокой распространенностью и высокой смертностью в Китае, и поэтому у китайских ученых есть свой исторический долг разработать новые способы профилактики и лечения ESCC. Кроме того, мы рады видеть, что такой успех достигается благодаря совместным усилиям нескольких исследовательских институтов и больниц."
Лин Ли, главный исследователь этого проекта в BGI, сказал:, "Это большой прогресс в генетических исследованиях плоскоклеточного рака пищевода. Эти результаты позволят по-новому взглянуть на понимание туморогенеза ESCC и помогут клиницистам разработать более эффективные диагностические и терапевтические подходы к ESCC. Более того, геномные данные, полученные в этом исследовании, также закладывают прочную основу для наших дальнейших исследований ESCC."