Пересмотр истории ВИЧ

МИННЕАПОЛИС, МИННЕСОТА – Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ 1) ответственный за большинство случаев СПИДа в мире заразил людей приблизительно 100 лет назад, больше чем на 20 лет ранее, чем ранее веривший, согласно результатам, представленным здесь на этой неделе на встрече Развития 2008 года. Его менее известный кузен, ВИЧ 2, вскочил в людей несколько десятилетий спустя от вида обезьян, несшего вирус в течение всего нескольких сотен лет, не, миллионы исследователей лет приняли, согласно другому исследованию, представленному на встрече.Исследователи пытаются придавить происхождение обоих HIVs, чтобы понять, как часто появляются новые человеческие вирусы.

Оба явились результатом обезьяноподобных вирусов иммунодефицита (SIVs) других приматов.Первые подсказки, что исследователи были на ложном пути о SIV, приведшем к ВИЧ 2, прибыли в прошлом году.

Исследователи предположили, что, потому что большинство видов обезьян, зараженных SIV, не заболело, вирус одновременно эволюционировал с приматами в течение миллионов лет, позволяя хозяину и патогену мирно сосуществовать. Если бы это имело место, то переход родословной обезьяны должен соответствовать переходу дерева SIV.

Но в прошлом году, Аризонский университет, Тусон, аспирант Джоэл Вертейм, его советник, Майкл Уороби и коллеги нашли что не иметь место для африканской зеленой обезьяны и ее SIV. «Работа предположила, что вирусу не были миллионов лет», Вертайм, сказанный на встрече.Для лучше придавливания происхождения SIVs Wertheim тогда собрал образцы вируса от закопченных мангабеев в Африке и в американских центрах для приматов. (Эти образцы были намного более многочисленными, чем вирус от африканских зеленых обезьян.) Он сравнил генетические последовательности в тех образцах SIV с последовательностями от некоторых африканская зеленая обезьяна образцы SIV, которые он имел, а также к последовательностям человеческого ВИЧ 2 и макака SIV.

Вертайм использовал сложную компьютерную программу для строительства родословной на основе градуса различий среди последовательностей. Анализ также определил, когда различные напряжения – ветвятся на этом дереве – появился. Закопченный мангабей поймал свой первый SIV в 1808, и он вскочил в людей 125 лет спустя для становления ВИЧ 2, он явился во встречу.Во втором исследовании другой из аспирантов Уороби, Марлеи Джеммеля, проанализировал ВИЧ 1 генофонд, полученный из ткани лимфы, забранной в 1960 из университета отдела патологии Киншасы в Демократической Республике Конго – только второе предшествование последовательности ВИЧ 1976, расшифрованный до настоящего времени.

К настоящему времени она упорядочила приблизительно 1 000 основ ДНК, которые у нее есть по сравнению с последовательностью, о которой ранее сообщают, ВИЧ 1 извлеченный от замороженного образца крови с 1959. Так как это вступило в людей, ВИЧ 1 развивался в различные поднапряжения – но последовательности 1960 и 1959 годов были намного более расходящимися, чем ожидаемый, Джеммель явился во встречу. «Это отражает долгое прошлое диверсификации до 1960», сказала она.Путем сравнения этих двух последовательностей с более свежими Джеммель смог показать что ВИЧ 1 первый введенный человек приблизительно в 1908, не 1931, как более ранние исследования только с найденным образцом 1959 года. Ее анализ также указывает, что вирус существовал в низких уровнях в людях до середины 20-го века. «Это соответствует повышению центров сосредоточения населения», объяснил Джеммель, предположив, что урбанизация в то время проложила путь к эпидемии СПИДа.

Эксперты впечатлены обоими результатами. Группа Worobey «применяет современные инструменты и управляет для большого количества важных вопросов» в проливании света на происхождение эпидемии СПИДа, говорит Джон Логсдон младший, эволюционный биолог в университете Айовы, Айова-Сити.

Эти исследования также помогают нам понять, как ВИЧ работает, говорит Дэвида Хиллиса, эволюционного биолога в университете Техаса, Остина. Например, эксперты по СПИДу предположили, что болезнь так тяжела в людях – еще меньше у большинства обезьян – потому что у людей не было времени для развития надлежащей обороноспособности против вируса, который имеют много других приматов. «Но происхождение вокруг того же порядка величины», и тем не менее обезьяны не заболели, говорит Хиллис. «Это указывает, что существуют другие направления, которые мы должны пойти для понимания [ядовитость]».